Avrupa Birliği uyum çalışmaları kapsamında yapısı ve işleyişi yeniden düzenlenen Milli Güvenlik Kurulu Genel Sekreterliği, kapılarını Türk ve dünya kamuoyuna açtı. İlk sivil Genel Sekreter Yiğit Alpogan’ın düzenlediği basın toplantısına yerli ve yabancı gazeteciler, büyükelçiliklerin basın ataşeleri ile bazı sivil toplum kuruluşlarının temsilcileri katıldı. Alpogan, MGK’nın kurulduğu 1933 yılından bu yana ilk defa böyle bir toplantı organize edildiğini belirtirken, Genel Sekreterliği, “MGK’ya politika kağıtları üreten sınırlı bir think-tank kuruluşu” olarak tanımladı. MGK’nın gelişmiş ülkelerde küçük, etkin ve uzmanlardan oluşan bir kuruluş olarak çalıştığına dikkat çeken Alpogan, Türkiye’de de birtakım düzenlemelerle Genel Sekreterlik’in işlevinin küçültüldüğünü anlattı. Alpogan, bir icra görevi görmediklerini, kendilerine çizilen görevin dışına çıkamayacaklarını vurguladı.
Geçmişte vatandaşların fişlendiği yönündeki iddiaları ‘Kurumun tarihinde böyle bir olay yaşanmadı.’ sözleriyle reddeden Alpogan, hazırlanan bazı psikolojik harekat planlarının yakıldığı haberlerini ise yalanladı: “Türk devletinin geleneğinde belge yakmak yoktur. Bunlar arşive kaldırılmıştır, ancak bir işlev görmemektedir.”
Basın toplantısında Milli Güvenlik Siyaset Belgesi’nin değişeceği haberlerini de değerlendiren Yiğit Alpogan şunları kaydetti: “3-5 yılda bir yeniden gözden geçirme yapılır. Bu normaldir. Beni heyecanlandırmıyor. Biz bir taslak hazırlayacağız ve buna Bakanlar Kurulu karar verecek.”
Alpogan, açıklık ve şeffaflığın çalışma ilkelerinin başında geldiğinin altını çizdi. Bu kapsamda internetteki web sayfasının tadilat yapılarak daha da geliştirileceğini ve İngilizce sayfaların da burada yer alacağını söyledi. Basınla ilişkiler konusunda da ‘iyi ilişkiler içinde olma' sözü veren Alpogan, kendisinin ve MGK yöneticilerinin her türlü soruyu her zaman cevaplandırmaya açık olduklarını kaydetti.
Kurulun teşkilat yapısıyla ilgili bilgi veren Alpogan, Seferberlik Dairesi'nin daha çok muhtemel bir depreme ilişkin koordinasyon görevi gördüğü bilgisini verdi. Alpogan, ayrıca her yıl yapılan muhtemel bir hayali savaşın ülkemize etkisinin ne olacağıyla ilgili bir tatbikatın Güvenlik 2004 tatbikatı adı altında aralık ayında yapılacağını dile getirdi.
Alpogan, ayrıca MGK zabıtlarının duyurulacağını da açıkladı. 1972'ye kadar olan zabıtların açık olduğunu belirten Alpogan diğerlerinin tasniflerinin yapılarak basına da sunulabileceğini bildirdi. Bir gazetecinin MGK'nın bu denli şeffaf hale gelmesinin ve yetkilerinin azalmasının bir zafiyet doğurup doğurmayacağı yönündeki sorusuna Alpogan şu cevabı verdi: “MGK Genel Sekreterliği esas fonksiyonunu icra etmesi gerektiği yerde durmaktadır. En önemli fonksiyonumuzda bir değişiklik olmamıştır. Biz karar vericilere fikri malzemeyi ve materyali verince görevimiz bitiyor. Biz bir istişari organız, bir icrai görevimiz yok. Bize tanımlanan yerde durmak en doğrusu.” Milli Güvenlik Kurulu Genel Sekreteri Yiğit Alpogan, bir başka soruyu cevaplarken, MGK’nın bugüne kadar ‘fişleme’ yapmadığını söyledi. MGK Genel Sekreteri, “Fişleme olmadığı için bunların yakılması da söz konusu değildir.” diye konuştu.
Yiğit Alpogan, Yunanistan'ın bir tehdit oluşturup oluşturmadığıyla ilgili soruya, Yunanistan ile Türkiye arasında 1999'da beri gelişen ilişkiyi anlatarak cevaplandırdı. İki ülke arasındaki ticari hacmin 2,5 milyar dolar olduğunu, turist sayının 800 binlere vardığını, Yunanistan'dan Türkiye'de 76 firmanın 642 milyon dolarlık yatırım yaptığını aktardı. Alpogan, Yunistan'ın Türkiye'nin AB perspektifine verdiği desteğe de atıfta bulundu. Kıbrıs'ın AB sürecinde önemi ve Güney Kıbrıs'ın tanınıp tanınmayacağı sorusu da soruldu Alpogan'a. MGK Genel Sekreteri, Kıbrıs'ın sürekli MGK'nın ilgi sahasında olduğunu, Güney Kıbrıs'ın tanınması konusunda diğer yetkili kurulların cevap verebileceğini ifade etti. Ancak tanınma olayından çok daha önce başka konuların çözüme kavuşturulması gerektiğine işaret eden Alpogan, Kıbrıs'la ilgili zamanı geldiğinde MGK üyelerine politika kağıtları sunacaklarını söyledi. Politik Psikolojik Merkezi ile ilgili bir başka soruya ise Alpogan, böyle bir birimin varlığından haberdar olmadığını ifade etti. Alpogan'ın toplantı sırasındaki ‘MGK toplantı tutanaklarının açıklanacağı’ ifadesiyle, ‘MGK toplantılarına ilişkin basın bildirilerini kastettiği’ belirtildi.